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15秒完成一次CT圖像診斷 “天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī)搭建CT影像智能診斷平臺(tái)
平安是對(duì)社會(huì)最大的貢獻(xiàn)
為打贏疫情防控人民戰(zhàn)爭(zhēng)、總體戰(zhàn)、阻擊戰(zhàn)提供強(qiáng)大科技支撐
2020年新年開(kāi)局,一場(chǎng)突如其來(lái)的新冠肺炎疫情席卷全國(guó),給人民生命安全和經(jīng)濟(jì)社會(huì)發(fā)展帶來(lái)嚴(yán)峻考驗(yàn)。在這場(chǎng)不能輸?shù)膽?zhàn)爭(zhēng)中,廣州科技力量精銳盡出。在國(guó)家超級(jí)計(jì)算廣州中心,“天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī),以每秒最高十億億次的超強(qiáng)算力,助力篩選出能抑制病毒的小分子藥物,搭建“15秒斷診”的新冠肺炎CT影像智能診斷平臺(tái),建立新冠肺炎病患時(shí)空軌跡數(shù)據(jù)庫(kù)……以大國(guó)重器之力,與時(shí)間賽跑,與死神戰(zhàn)斗。
在“天河二號(hào)”的輔助下,科學(xué)團(tuán)隊(duì)篩選出的某藥物與冠狀病毒蛋白的模擬結(jié)合模型。
重器之下還有人。大年初九,廣州智睿醫(yī)藥科技有限公司首席執(zhí)行官謝偉東博士搭上一班空蕩蕩的飛機(jī),從加拿大返回廣州。彼時(shí),智睿醫(yī)藥已通過(guò)“天河二號(hào)”從數(shù)千種上市藥物中篩選出30余種潛在藥物。但戰(zhàn)斗沒(méi)結(jié)束,他還要借助超算與人工智能算法的力量,從上億種化合物中繼續(xù)尋找對(duì)新冠病毒有特效的“克星”。
“人類(lèi)同疾病較量最有力的武器就是科學(xué)技術(shù)?!睆V州超算,已全面融入防控疫情的主戰(zhàn)場(chǎng),彰顯國(guó)之重器的力量與擔(dān)當(dāng)。
文、圖/廣州日?qǐng)?bào)全媒體記者方晴 通訊員莫倩
找藥:兩三天選出30種潛在藥物
年廿八,在登上去加拿大的飛機(jī)前,謝偉東從長(zhǎng)期合作伙伴廣州呼吸疾病研究所處聽(tīng)說(shuō)了新冠病毒所引發(fā)肺炎疫情的嚴(yán)重性。從事多年分子生物學(xué)研究和藥物篩選研發(fā)的他馬上意識(shí)到,對(duì)沒(méi)有特效藥的未知病毒,“老藥新用”是最快也最安全的。篩選出有效的“老藥”,正是他的強(qiáng)項(xiàng)!
作為一家把人工智能應(yīng)用于新藥挖掘的企業(yè),智睿醫(yī)藥自主研發(fā)了一套深度學(xué)習(xí)算法系統(tǒng),過(guò)去一年半以來(lái),該公司一直借助廣州超算中心的“天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī)開(kāi)展化合物篩選、藥物挖掘。
謝偉東告訴記者,用算法篩查藥物的原理是,針對(duì)病毒結(jié)構(gòu)的特定靶點(diǎn),把藥物化合物結(jié)構(gòu)輸入到系統(tǒng)中,跟靶點(diǎn)進(jìn)行對(duì)接,通過(guò)多個(gè)指標(biāo)評(píng)價(jià)其對(duì)接的情況,結(jié)合越好,代表藥物化合物效果更好。
為什么要用到超算?“因?yàn)榈鞍拙w是一個(gè)很復(fù)雜的結(jié)構(gòu),要用虛擬小分子找它的活性位,甚至需要幾百萬(wàn)次的嘗試。”以普通計(jì)算機(jī)的算力,從所有上市藥物中篩選出有效的藥物,需要2至3個(gè)月。而以“天河二號(hào)”的算力,只需要兩三天?!霸谶@個(gè)過(guò)程中,超算、大數(shù)據(jù)、人工智能,缺一不可?!?
大年初二(1月26日),上海科技大學(xué)饒子和/楊海濤課題組公布了測(cè)量的2019-nCoV冠狀病毒3CL水解酶(Mpro)的高分率晶體結(jié)構(gòu)。
同日,智睿醫(yī)藥研究團(tuán)隊(duì)馬上聯(lián)動(dòng)廣州超算中心科研團(tuán)隊(duì),啟動(dòng)了基于“星光超算應(yīng)用服務(wù)平臺(tái)”上自主研發(fā)的集合傳統(tǒng)統(tǒng)計(jì)、高通量計(jì)算、以及最新AI方法的藥物篩選軟件平臺(tái),在“天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī)上重點(diǎn)針對(duì)已上市藥物進(jìn)行了藥物虛擬篩選。
兩三天時(shí)間,便迅速定位了30余種可能起作用的潛在藥物,包括六種此前未見(jiàn)報(bào)道的藥物。團(tuán)隊(duì)把這些結(jié)果全部公布在網(wǎng)上,供科研機(jī)構(gòu)無(wú)償使用。
- 原標(biāo)題:15秒完成一次CT圖像診斷 “天河二號(hào)”超級(jí)計(jì)算機(jī)搭建CT影像智能診斷平臺(tái)
- 責(zé)任編輯: 郭涵 
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