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2002年，首例SARS（非典型肺炎，嚴重急性呼吸道綜合征）爆發(fā)于廣東佛山。15年之后，在距離佛山100多公里的清遠的某個養(yǎng)豬場內(nèi)，開始爆發(fā)一場嚴重的豬疫情，小仔豬在這場疫情里尤為脆弱，發(fā)病2天后即會死亡。

據(jù)澎湃新聞5日報道，相關(guān)人員針對這些死豬檢測了所有已知的病毒后，均顯示為陰性，這讓人開始意識到：或許是一種未知的新疫情已經(jīng)到來。與此同時，養(yǎng)豬場附近發(fā)現(xiàn)有蝙蝠出沒，它們飛翔在上空，對豬場“投下”糞便，然后飛回棲息地。而棲息地或許正位于豬場附近的山丘里。

這則新疫情最后的破解者是中國SARS病毒的源頭攻克團隊。中國科學院武漢病毒研究所研究院石正麗團隊是團隊負責人之一， “我們通過這項工作想提示一下，無論是養(yǎng)殖業(yè)還是公共衛(wèi)生，我們都要提前去預防由這些野生動物傳到人類社會的這些病原，完全可以避免傳染病的大規(guī)模爆發(fā)?！?

石正麗等人在2005年曾在菊頭蝠身上找到了和SARS病毒相似的冠狀病毒，并于當年將成果刊發(fā)于《科學》（Science）。2017年，石正麗等人終于在13年之后，在云南昆明地區(qū)一個小山洞里的蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)了SARS病毒所有基因組成，基本完成了對SARS病毒的溯源工作。

而據(jù)工作人員介紹，研究團隊在論文中將此番新發(fā)現(xiàn)的SADS疫情和當年的SARS聯(lián)系在了一起，并提到3個相似和1個不同。

媒體2017年報道截圖

SARS樣冠狀病毒的自然宿主菊頭蝠。廣東省昆蟲研究所張禮標研究員供圖

破解最新這一疫情的成果于北京時間4月5日凌晨在線發(fā)表在頂級學術(shù)期刊《自然》（Nature）。論文的并列第一作者、中科院武漢病毒研究所研究員周鵬在接受澎湃新聞采訪時表示，“我們通過高通量測序后發(fā)現(xiàn)，這是一種新的病毒，和來源于蝙蝠的HKU2官網(wǎng)病毒有95%的同源性，大家才意識到，這可能真的是來源于蝙蝠的一種病毒?！?

值得一提的是，得益于此前十余年的SARS研究，該成果前后只花了2個多月的時間。通訊作者之一、杜克-新加坡國立大學醫(yī)學院新發(fā)突發(fā)傳染病研究所所長王林發(fā)提到，“這得益于大合作?！?

王林發(fā)表示，任何單獨一個組都無法快速完成這所有的工作。除石正麗、王林發(fā)，該論文的通訊作者還包括美國生態(tài)健康聯(lián)盟（EcoHealth Alliance）主席Peter Daszak、軍事醫(yī)學科學院微生物流行病研究所童貽剛、華中農(nóng)業(yè)大學動物科學學院馬靜云。

4個養(yǎng)豬場爆發(fā)疫情

2016年10月28日起，廣東清遠的一處養(yǎng)豬場開始爆發(fā)致命的豬疫情。隨后，在距離該養(yǎng)豬場20-150千米范圍內(nèi)的另外3個農(nóng)場中也相繼爆發(fā)了該疫情。

截至2017年5月2日，差不多半年時間內(nèi)，該疫情共計導致了4個養(yǎng)豬場中24693頭仔豬的死亡。在A農(nóng)場里，2月份出生的仔豬有64%（4659/7268）最終病死。

而最先爆發(fā)疫情的養(yǎng)豬場此前已經(jīng)因豬流行性腹瀉病毒（PEDV，一種冠狀病毒）爆發(fā)過疫情。論文中提到，最初在死豬的腸里發(fā)現(xiàn)PEDV病毒，然而2017年1月12日之后，小死豬的腸里再也檢測不到PEDV。

盡管死豬在急速增加，“但檢測了所有已知的病毒，顯示全部都是陰性的?！敝荠i提到。這些信息都在提示，這次疫情爆發(fā)是一種新的疾病。這一新的疫情最終被命名為豬急性腹瀉綜合征（SADS）。

該疫情的臨床癥狀和其他已知的腸道冠狀病毒引起的疫情相似，包括急性腹瀉、急性嘔吐。剛出生的仔豬在這場疫情面前尤其脆弱，出生5天以內(nèi)的仔豬會因體重快速下降而在發(fā)病2-4天后即死亡。

相比之下，隨著仔豬逐漸長大，存活幾率會大增。5天或更小仔豬發(fā)病后的死亡率高達90%，在8天或更大的仔豬身上，這一死亡率就可下降到5%。同樣感染病毒的母豬生存幾率則更大一些，只會表現(xiàn)出輕微腹瀉，大多在2天后即恢復。

截至論文中接收前，疫情已經(jīng)減弱。研究人員用將生病母豬和仔豬從豬群中隔離出來等措施控制疫情。

石正麗研究組在野外作業(yè)。中國科學院武漢病毒研究所供圖

SADS冠狀病毒導致疫情

基于SADS是一種未知病毒引起的新疫情這點假設(shè)，研究團隊開始正式解謎。

研究團隊從患病仔豬小腸中收集樣本，用高通量測序技術(shù)來進行宏基因組學分析。最終發(fā)現(xiàn)，SADS冠狀病毒和蝙蝠冠狀病毒HKU2序列匹配。通過重新組裝，研究團隊獲得了27173bp的SADS冠狀病毒基因，和HKU2冠狀病毒有95%的序列一致性。HKU2首先發(fā)現(xiàn)于在香港和廣東的中華菊頭蝠中。

研究團隊發(fā)現(xiàn)，在4個養(yǎng)豬場的急性病仔豬和母豬身上均檢測到了SADS冠狀病毒，在恢復或健康的豬身上則沒有，在附近沒有SADS跡象的養(yǎng)豬場里也沒有檢測到。

回顧性PCR分析顯示，在PEDV爆發(fā)的時候，A農(nóng)場里還同時存在SADS冠狀病毒，該農(nóng)場里于2016年12月提取的第一個樣本表現(xiàn)出SADS冠狀病毒強陽性。但從2017年1月中旬開始，SADS冠狀病毒成為了病豬里檢測到的主要病毒。

研究團隊認為，在PEDV感染完全檢測不到后出現(xiàn)了仔豬的大規(guī)模死亡這一事實，暗示是SADS冠狀病毒引起了豬的致命感染，是那些大規(guī)模疫情爆發(fā)的真正原因，PEDV則不是直接因素。

在SADS爆發(fā)高峰期、以及爆發(fā)后期，4個養(yǎng)豬場里都沒有檢測到PEDV和其他一直的豬腹瀉病毒的存在，這些都支持了上述結(jié)論。